COVID-19 variants

Varianti emergenti SARS-CoV-2 

Rilevazione di Omicron rispetto a Delta e altre varianti

Programma di sorveglianza

Data la continua mutazione del virus SARS-CoV-2 e il proliferare di numerose varianti a livello globale, Siemens Healthineers si impegna nell’assicurarti un attivo programma di sorveglianza. Monitoriamo costantemente le pubblicazioni su questo tema e il Database GISAD per verificare le performance dei test FTDTM SARS-CoV-2 Assay1 e FTD SARS-CoV-2/FluA/FluB/HRSV Assay2

L’ultimo aggiornamento, dal database GISAD (www.gisaid.org) del 17 luglio 2022, si basa sulla precedente analisi in silico su 11.428.775 di sequenze complete per il target ORF1ab e su 11.418.035 di sequenze complete per il gene N target del virus SARS-CoV-2. Più di recente, il 16 gennaio 2023, tutte le sequenze disponibili per XBB.1.5, BF.7 e BQ.1 sono state scaricate dal database GISAD: sono state analizzate 76,634 sequenze per il target ORF1ab e 76,557 per il target gene N.

I test FTD SARS-CoV-2 Assay e FTD SARS-CoV-2/FluA/FluB/HRSV Assay sono in grado di identificare le principali varianti e clades di SARS-CoV-2 che sono al momento in circolazione. Le nostre recenti analisi in silico hanno dimostrato che tutte le sequenze analizzate sono state individuate con una percentuale di del 100%, sia sul gene N, sia su ORF1ab, con un massimo di 3 disallineamenti. Grazie al dual target design, almeno uno dei due test è in grado di identificare una sequenza senza mismatch . Quindi, i test FTD SARS-CoV-2 Assay e FTD SARS-CoV-2/FluA/FluB/HRSV Assay non hanno riscontrato problemi di performance nell’identificazione di subvarianti.


Varianti e generi di SARS-CoV-2 in circolazione identificate dai test FTD SARS-CoV-2 Assay e FTD SARS-CoV-2/FluA/FluB/HRSV Assay

WHO label

PANGO Lineage

GISAID clade

Nextstrain clade

Relazione con altri VOC lineages

 in circolazione

Data di designazione 

del primo documento

Variants of Concern (VOC)

Omicron

B.1.1.529

GR/484A

21K, 21L, 21M,

22A, 22B, 22C, 22D

NA

26 Nov 2021

Omicron subvarianti monitorate

/

BF.7

GRA

22B

BA.5 sublineage

24 Gen 2022

/

BQ.1

GRA

22E

BA.5 sublineage

07 Feb 2022

/

BA.2.75

GRA

22D

BA.2 sublineage 

31 Dic 2021

/

XBB

/

22F

Recombinant of BA.2.10.1 

e BA.2.75 sublineages

13 Aug 2022

Flusso di test delle varianti 

Gli eluati di campioni positivi vengono testati in reflex test con i test Diagnovital L452R (RUO)4 e Diagnovital K417N (RUO)4 per distinguere la variante Omicron da quella Delta, in casi sospetti.

Per saperne di più clicca sul grafico qui sotto.

Diagnosis
 

SARS-CoV-2 Detection

Profiling
 

Mutation Profiling

Sequencing
(optional)

Complete Analysis of the Viral Genome

    Collaborazione con A1 Life Sciences per analizzare le varianti

    Kit A1 Life Sciences' Diagnovital

    Il test FTD SARS-CoV-21 utilizzato per la diagnosi iniziale dell’infezione da virus SARS-CoV-2, è integrato dai kit del portfolio A1 Life Sciences‘ Diagnovital Research Use Only (RUO), progettati per identificare le successive mutazioni del virus SARS-CoV-2. Il portfolio Diagnovital A1 Life Sciences distribuito da Siemens Healthineers sarà disponibile a livello globale per esclusivo utilizzo di ricerca (RUO).

    a representation of covid-19 variants with viruses colored differently

    Profilazione della mutazione di SARS-CoV-2

    Real-time PCR SARS-CoV-2 assays

    E’ stato confermato che i test FTD SARS-CoV-2 Assay e FTD SARS-CoV-2/FluA/FluB/HRSV Assay sono in grado di identificare le principali varianti e clades di SARS-CoV-2 che sono al momento in circolazione con una percentuale di identificazione del 100%.

    Descrizione del prodotto

    Numero materiale Siemens

    FTD SARS-CoV-2/FluA/FluB/HRSV Assay (CE-marked IVD; 48 reactions)

    10731383

    FTD SARS-CoV-2 Assay (CE-marked IVD; 96 reactions)5

    11416284

    FTD SARS-CoV-2 Assay (EUA granted by US FDA; 96 reactions)5

    11416302

    1
    2
    3
    4
    5